Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4921530L21RikQ9CQ47 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4921530L21RikQ9CQ47 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4921530L21RikQ9CQ47 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4921530L21RikQ9CQ47 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4921530L21RikQ9CQ47 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4921530L21RikQ9CQ47 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4921530L21RikQ9CQ47 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4921530L21RikQ9CQ47 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4921530L21RikQ9CQ47 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4921530L21RikQ9CQ47 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4921530L21RikQ9CQ47 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
4921530L21RikQ9CQ47 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4921530L21RikQ9CQ47 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4921530L21RikQ9CQ47 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4921530L21RikQ9CQ47 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4921530L21RikQ9CQ47 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
4921530L21RikQ9CQ47 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4921530L21RikQ9CQ47 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4921530L21RikQ9CQ47 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4921530L21RikQ9CQ47 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4921530L21RikQ9CQ47 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4921530L21RikQ9CQ47 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4921530L21RikQ9CQ47 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4921530L21RikQ9CQ47 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4921530L21RikQ9CQ47 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4921530L21RikQ9CQ47 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4921530L21RikQ9CQ47 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4921530L21RikQ9CQ47 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4921530L21RikQ9CQ47 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4921530L21RikQ9CQ47 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4921530L21RikQ9CQ47 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4921530L21RikQ9CQ47 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4921530L21RikQ9CQ47 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4921530L21RikQ9CQ47 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4921530L21RikQ9CQ47 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4921530L21RikQ9CQ47 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4921530L21RikQ9CQ47 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4921530L21RikQ9CQ47 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4921530L21RikQ9CQ47 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4921530L21RikQ9CQ47 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4921530L21RikQ9CQ47 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4921530L21RikQ9CQ47 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4921530L21RikQ9CQ47 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4921530L21RikQ9CQ47 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4921530L21RikQ9CQ47 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4921530L21RikQ9CQ47 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4921530L21RikQ9CQ47 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4921530L21RikQ9CQ47 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4921530L21RikQ9CQ47 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4921530L21RikQ9CQ47 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4921530L21RikQ9CQ47 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4921530L21RikQ9CQ47 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4921530L21RikQ9CQ47 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4921530L21RikQ9CQ47 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4921530L21RikQ9CQ47 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4921530L21RikQ9CQ47 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4921530L21RikQ9CQ47 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms