Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cadm3Q99N28 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cadm3Q99N28 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cadm3Q99N28 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cadm3Q99N28 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cadm3Q99N28 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cadm3Q99N28 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cadm3Q99N28 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms