Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf19Q99KP6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf19Q99KP6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf19Q99KP6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf19Q99KP6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf19Q99KP6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf19Q99KP6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf19Q99KP6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf19Q99KP6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf19Q99KP6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf19Q99KP6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf19Q99KP6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf19Q99KP6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf19Q99KP6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf19Q99KP6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf19Q99KP6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf19Q99KP6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf19Q99KP6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf19Q99KP6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf19Q99KP6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf19Q99KP6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf19Q99KP6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf19Q99KP6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf19Q99KP6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf19Q99KP6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf19Q99KP6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf19Q99KP6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf19Q99KP6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf19Q99KP6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf19Q99KP6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf19Q99KP6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf19Q99KP6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf19Q99KP6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf19Q99KP6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf19Q99KP6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf19Q99KP6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf19Q99KP6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf19Q99KP6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf19Q99KP6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf19Q99KP6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf19Q99KP6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf19Q99KP6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf19Q99KP6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prpf19Q99KP6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prpf19Q99KP6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prpf19Q99KP6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms