Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,57
Usp11Q99K46 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24,88■■□□□ 1,57
Usp11Q99K46 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Usp11Q99K46 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Usp11Q99K46 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Usp11Q99K46 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Usp11Q99K46 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Usp11Q99K46 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Usp11Q99K46 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Usp11Q99K46 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Usp11Q99K46 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Usp11Q99K46 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Usp11Q99K46 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Usp11Q99K46 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Usp11Q99K46 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Usp11Q99K46 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Usp11Q99K46 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24,78■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Usp11Q99K46 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Usp11Q99K46 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Usp11Q99K46 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24,6■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24,59■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Usp11Q99K46 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Usp11Q99K46 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Usp11Q99K46 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Usp11Q99K46 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,1 ms