Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smc6Q924W5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smc6Q924W5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smc6Q924W5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smc6Q924W5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smc6Q924W5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc6Q924W5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smc6Q924W5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc6Q924W5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc6Q924W5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smc6Q924W5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc6Q924W5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc6Q924W5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc6Q924W5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smc6Q924W5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc6Q924W5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc6Q924W5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc6Q924W5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smc6Q924W5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc6Q924W5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smc6Q924W5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc6Q924W5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smc6Q924W5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc6Q924W5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smc6Q924W5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc6Q924W5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smc6Q924W5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smc6Q924W5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smc6Q924W5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc6Q924W5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smc6Q924W5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smc6Q924W5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smc6Q924W5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smc6Q924W5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smc6Q924W5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smc6Q924W5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms