Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtn4ip1Q924D0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtn4ip1Q924D0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtn4ip1Q924D0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtn4ip1Q924D0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rtn4ip1Q924D0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rtn4ip1Q924D0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rtn4ip1Q924D0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtn4ip1Q924D0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtn4ip1Q924D0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtn4ip1Q924D0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtn4ip1Q924D0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtn4ip1Q924D0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtn4ip1Q924D0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtn4ip1Q924D0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtn4ip1Q924D0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtn4ip1Q924D0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtn4ip1Q924D0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtn4ip1Q924D0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtn4ip1Q924D0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtn4ip1Q924D0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtn4ip1Q924D0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtn4ip1Q924D0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtn4ip1Q924D0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtn4ip1Q924D0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtn4ip1Q924D0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtn4ip1Q924D0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtn4ip1Q924D0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rtn4ip1Q924D0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rtn4ip1Q924D0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rtn4ip1Q924D0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rtn4ip1Q924D0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtn4ip1Q924D0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rtn4ip1Q924D0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtn4ip1Q924D0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rtn4ip1Q924D0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtn4ip1Q924D0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtn4ip1Q924D0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtn4ip1Q924D0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rtn4ip1Q924D0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtn4ip1Q924D0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtn4ip1Q924D0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtn4ip1Q924D0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtn4ip1Q924D0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rtn4ip1Q924D0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rtn4ip1Q924D0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms