Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU0

Fam3c, Protein FAM3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3cQ91VU0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam3cQ91VU0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam3cQ91VU0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam3cQ91VU0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam3cQ91VU0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam3cQ91VU0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam3cQ91VU0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam3cQ91VU0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam3cQ91VU0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam3cQ91VU0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam3cQ91VU0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam3cQ91VU0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam3cQ91VU0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam3cQ91VU0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam3cQ91VU0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam3cQ91VU0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam3cQ91VU0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam3cQ91VU0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam3cQ91VU0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam3cQ91VU0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam3cQ91VU0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam3cQ91VU0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam3cQ91VU0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam3cQ91VU0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam3cQ91VU0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam3cQ91VU0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam3cQ91VU0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam3cQ91VU0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam3cQ91VU0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam3cQ91VU0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam3cQ91VU0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam3cQ91VU0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam3cQ91VU0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam3cQ91VU0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam3cQ91VU0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam3cQ91VU0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam3cQ91VU0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam3cQ91VU0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam3cQ91VU0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam3cQ91VU0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms