Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps4aQ8VEJ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vps4aQ8VEJ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps4aQ8VEJ9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps4aQ8VEJ9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps4aQ8VEJ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps4aQ8VEJ9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps4aQ8VEJ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps4aQ8VEJ9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps4aQ8VEJ9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps4aQ8VEJ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps4aQ8VEJ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps4aQ8VEJ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps4aQ8VEJ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps4aQ8VEJ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps4aQ8VEJ9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps4aQ8VEJ9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps4aQ8VEJ9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps4aQ8VEJ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps4aQ8VEJ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps4aQ8VEJ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps4aQ8VEJ9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps4aQ8VEJ9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps4aQ8VEJ9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps4aQ8VEJ9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps4aQ8VEJ9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps4aQ8VEJ9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps4aQ8VEJ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps4aQ8VEJ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps4aQ8VEJ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps4aQ8VEJ9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps4aQ8VEJ9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps4aQ8VEJ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps4aQ8VEJ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps4aQ8VEJ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps4aQ8VEJ9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps4aQ8VEJ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms