Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Itgbl1Q8VDV0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Itgbl1Q8VDV0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Itgbl1Q8VDV0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Itgbl1Q8VDV0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Itgbl1Q8VDV0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Itgbl1Q8VDV0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Itgbl1Q8VDV0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Itgbl1Q8VDV0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Itgbl1Q8VDV0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Itgbl1Q8VDV0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Itgbl1Q8VDV0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Itgbl1Q8VDV0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Itgbl1Q8VDV0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Itgbl1Q8VDV0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Itgbl1Q8VDV0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Itgbl1Q8VDV0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Itgbl1Q8VDV0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Itgbl1Q8VDV0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itgbl1Q8VDV0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itgbl1Q8VDV0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Itgbl1Q8VDV0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Itgbl1Q8VDV0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Itgbl1Q8VDV0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Itgbl1Q8VDV0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Itgbl1Q8VDV0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Itgbl1Q8VDV0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Itgbl1Q8VDV0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itgbl1Q8VDV0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itgbl1Q8VDV0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itgbl1Q8VDV0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itgbl1Q8VDV0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itgbl1Q8VDV0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itgbl1Q8VDV0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itgbl1Q8VDV0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itgbl1Q8VDV0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Itgbl1Q8VDV0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itgbl1Q8VDV0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Itgbl1Q8VDV0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itgbl1Q8VDV0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Itgbl1Q8VDV0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itgbl1Q8VDV0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Itgbl1Q8VDV0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Itgbl1Q8VDV0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Itgbl1Q8VDV0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Itgbl1Q8VDV0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Itgbl1Q8VDV0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Itgbl1Q8VDV0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Itgbl1Q8VDV0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itgbl1Q8VDV0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Itgbl1Q8VDV0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Itgbl1Q8VDV0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Itgbl1Q8VDV0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Itgbl1Q8VDV0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Itgbl1Q8VDV0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Itgbl1Q8VDV0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Itgbl1Q8VDV0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Itgbl1Q8VDV0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itgbl1Q8VDV0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itgbl1Q8VDV0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Itgbl1Q8VDV0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Itgbl1Q8VDV0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Itgbl1Q8VDV0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Itgbl1Q8VDV0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itgbl1Q8VDV0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itgbl1Q8VDV0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Itgbl1Q8VDV0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itgbl1Q8VDV0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itgbl1Q8VDV0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Itgbl1Q8VDV0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itgbl1Q8VDV0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itgbl1Q8VDV0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itgbl1Q8VDV0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itgbl1Q8VDV0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itgbl1Q8VDV0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itgbl1Q8VDV0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itgbl1Q8VDV0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itgbl1Q8VDV0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgbl1Q8VDV0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgbl1Q8VDV0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms