Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnaaf4Q8R368 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnaaf4Q8R368 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnaaf4Q8R368 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnaaf4Q8R368 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnaaf4Q8R368 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnaaf4Q8R368 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnaaf4Q8R368 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dnaaf4Q8R368 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dnaaf4Q8R368 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dnaaf4Q8R368 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dnaaf4Q8R368 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Dnaaf4Q8R368 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnaaf4Q8R368 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnaaf4Q8R368 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnaaf4Q8R368 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dnaaf4Q8R368 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dnaaf4Q8R368 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dnaaf4Q8R368 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dnaaf4Q8R368 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dnaaf4Q8R368 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dnaaf4Q8R368 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Dnaaf4Q8R368 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dnaaf4Q8R368 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dnaaf4Q8R368 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dnaaf4Q8R368 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dnaaf4Q8R368 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dnaaf4Q8R368 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Dnaaf4Q8R368 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dnaaf4Q8R368 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dnaaf4Q8R368 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Dnaaf4Q8R368 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Dnaaf4Q8R368 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Dnaaf4Q8R368 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dnaaf4Q8R368 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dnaaf4Q8R368 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dnaaf4Q8R368 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dnaaf4Q8R368 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Dnaaf4Q8R368 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dnaaf4Q8R368 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dnaaf4Q8R368 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dnaaf4Q8R368 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnaaf4Q8R368 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dnaaf4Q8R368 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dnaaf4Q8R368 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Dnaaf4Q8R368 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dnaaf4Q8R368 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dnaaf4Q8R368 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dnaaf4Q8R368 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dnaaf4Q8R368 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dnaaf4Q8R368 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Dnaaf4Q8R368 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dnaaf4Q8R368 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dnaaf4Q8R368 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dnaaf4Q8R368 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dnaaf4Q8R368 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dnaaf4Q8R368 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dnaaf4Q8R368 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dnaaf4Q8R368 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dnaaf4Q8R368 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dnaaf4Q8R368 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dnaaf4Q8R368 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dnaaf4Q8R368 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dnaaf4Q8R368 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dnaaf4Q8R368 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dnaaf4Q8R368 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnaaf4Q8R368 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnaaf4Q8R368 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnaaf4Q8R368 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dnaaf4Q8R368 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Dnaaf4Q8R368 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dnaaf4Q8R368 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dnaaf4Q8R368 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Dnaaf4Q8R368 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Dnaaf4Q8R368 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnaaf4Q8R368 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnaaf4Q8R368 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dnaaf4Q8R368 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dnaaf4Q8R368 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnaaf4Q8R368 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnaaf4Q8R368 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnaaf4Q8R368 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Dnaaf4Q8R368 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Dnaaf4Q8R368 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dnaaf4Q8R368 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dnaaf4Q8R368 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnaaf4Q8R368 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnaaf4Q8R368 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnaaf4Q8R368 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnaaf4Q8R368 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnaaf4Q8R368 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnaaf4Q8R368 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnaaf4Q8R368 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnaaf4Q8R368 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnaaf4Q8R368 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnaaf4Q8R368 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dnaaf4Q8R368 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnaaf4Q8R368 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dnaaf4Q8R368 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Dnaaf4Q8R368 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms