Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup58Q8R332 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup58Q8R332 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup58Q8R332 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup58Q8R332 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup58Q8R332 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup58Q8R332 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup58Q8R332 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup58Q8R332 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup58Q8R332 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup58Q8R332 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup58Q8R332 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup58Q8R332 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup58Q8R332 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup58Q8R332 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup58Q8R332 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup58Q8R332 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup58Q8R332 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup58Q8R332 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup58Q8R332 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup58Q8R332 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup58Q8R332 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup58Q8R332 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup58Q8R332 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup58Q8R332 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nup58Q8R332 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup58Q8R332 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup58Q8R332 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup58Q8R332 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup58Q8R332 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup58Q8R332 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup58Q8R332 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup58Q8R332 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup58Q8R332 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup58Q8R332 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup58Q8R332 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup58Q8R332 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup58Q8R332 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup58Q8R332 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup58Q8R332 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup58Q8R332 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup58Q8R332 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup58Q8R332 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup58Q8R332 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup58Q8R332 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup58Q8R332 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup58Q8R332 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup58Q8R332 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup58Q8R332 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup58Q8R332 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup58Q8R332 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup58Q8R332 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup58Q8R332 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup58Q8R332 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup58Q8R332 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup58Q8R332 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup58Q8R332 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup58Q8R332 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup58Q8R332 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup58Q8R332 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup58Q8R332 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup58Q8R332 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup58Q8R332 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup58Q8R332 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup58Q8R332 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup58Q8R332 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup58Q8R332 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup58Q8R332 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup58Q8R332 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup58Q8R332 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup58Q8R332 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nup58Q8R332 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup58Q8R332 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup58Q8R332 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup58Q8R332 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup58Q8R332 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms