Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scara5Q8K299 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scara5Q8K299 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scara5Q8K299 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scara5Q8K299 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scara5Q8K299 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Scara5Q8K299 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scara5Q8K299 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scara5Q8K299 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scara5Q8K299 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scara5Q8K299 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scara5Q8K299 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scara5Q8K299 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scara5Q8K299 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scara5Q8K299 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scara5Q8K299 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scara5Q8K299 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scara5Q8K299 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scara5Q8K299 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scara5Q8K299 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms