Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm9955Q8CEJ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm9955Q8CEJ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm9955Q8CEJ8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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