Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkiras1Q8CEC5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkiras1Q8CEC5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkiras1Q8CEC5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkiras1Q8CEC5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkiras1Q8CEC5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkiras1Q8CEC5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkiras1Q8CEC5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkiras1Q8CEC5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkiras1Q8CEC5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkiras1Q8CEC5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkiras1Q8CEC5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkiras1Q8CEC5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkiras1Q8CEC5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkiras1Q8CEC5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkiras1Q8CEC5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkiras1Q8CEC5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkiras1Q8CEC5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkiras1Q8CEC5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkiras1Q8CEC5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkiras1Q8CEC5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkiras1Q8CEC5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkiras1Q8CEC5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms