Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K6

Atxn7l2, Ataxin 7-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l2Q8C8K6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn7l2Q8C8K6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn7l2Q8C8K6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn7l2Q8C8K6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn7l2Q8C8K6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn7l2Q8C8K6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn7l2Q8C8K6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn7l2Q8C8K6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn7l2Q8C8K6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn7l2Q8C8K6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atxn7l2Q8C8K6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn7l2Q8C8K6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn7l2Q8C8K6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn7l2Q8C8K6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn7l2Q8C8K6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn7l2Q8C8K6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn7l2Q8C8K6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn7l2Q8C8K6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn7l2Q8C8K6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn7l2Q8C8K6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn7l2Q8C8K6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn7l2Q8C8K6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn7l2Q8C8K6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn7l2Q8C8K6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn7l2Q8C8K6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn7l2Q8C8K6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn7l2Q8C8K6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn7l2Q8C8K6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn7l2Q8C8K6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn7l2Q8C8K6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn7l2Q8C8K6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn7l2Q8C8K6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn7l2Q8C8K6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn7l2Q8C8K6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atxn7l2Q8C8K6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn7l2Q8C8K6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn7l2Q8C8K6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn7l2Q8C8K6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn7l2Q8C8K6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn7l2Q8C8K6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn7l2Q8C8K6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn7l2Q8C8K6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn7l2Q8C8K6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn7l2Q8C8K6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn7l2Q8C8K6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn7l2Q8C8K6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn7l2Q8C8K6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn7l2Q8C8K6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn7l2Q8C8K6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn7l2Q8C8K6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn7l2Q8C8K6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms