Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfrp1Q8BXL7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfrp1Q8BXL7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfrp1Q8BXL7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfrp1Q8BXL7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfrp1Q8BXL7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfrp1Q8BXL7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfrp1Q8BXL7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arfrp1Q8BXL7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Arfrp1Q8BXL7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfrp1Q8BXL7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfrp1Q8BXL7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms