Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp38Q8BW70 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp38Q8BW70 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp38Q8BW70 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp38Q8BW70 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp38Q8BW70 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp38Q8BW70 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp38Q8BW70 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp38Q8BW70 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp38Q8BW70 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp38Q8BW70 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp38Q8BW70 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp38Q8BW70 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp38Q8BW70 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp38Q8BW70 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp38Q8BW70 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp38Q8BW70 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp38Q8BW70 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp38Q8BW70 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp38Q8BW70 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp38Q8BW70 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp38Q8BW70 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp38Q8BW70 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp38Q8BW70 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp38Q8BW70 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp38Q8BW70 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp38Q8BW70 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp38Q8BW70 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp38Q8BW70 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp38Q8BW70 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp38Q8BW70 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp38Q8BW70 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp38Q8BW70 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp38Q8BW70 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp38Q8BW70 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp38Q8BW70 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp38Q8BW70 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp38Q8BW70 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp38Q8BW70 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp38Q8BW70 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp38Q8BW70 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp38Q8BW70 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp38Q8BW70 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp38Q8BW70 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp38Q8BW70 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp38Q8BW70 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp38Q8BW70 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp38Q8BW70 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp38Q8BW70 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp38Q8BW70 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp38Q8BW70 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp38Q8BW70 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp38Q8BW70 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp38Q8BW70 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp38Q8BW70 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp38Q8BW70 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp38Q8BW70 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp38Q8BW70 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp38Q8BW70 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp38Q8BW70 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp38Q8BW70 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp38Q8BW70 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp38Q8BW70 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp38Q8BW70 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp38Q8BW70 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
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