Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730596B20RikQ8BQ08 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms