Protein–RNA interactions for Protein: Q80W93

Hydin, Hydrocephalus-inducing protein, mousemouse

Predictions only

Length 5,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HydinQ80W93 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HydinQ80W93 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HydinQ80W93 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HydinQ80W93 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HydinQ80W93 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HydinQ80W93 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HydinQ80W93 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HydinQ80W93 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HydinQ80W93 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HydinQ80W93 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HydinQ80W93 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HydinQ80W93 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HydinQ80W93 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HydinQ80W93 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HydinQ80W93 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HydinQ80W93 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
HydinQ80W93 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HydinQ80W93 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HydinQ80W93 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HydinQ80W93 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HydinQ80W93 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HydinQ80W93 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HydinQ80W93 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HydinQ80W93 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HydinQ80W93 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HydinQ80W93 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HydinQ80W93 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
HydinQ80W93 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HydinQ80W93 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms