Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PhkbQ7TSH2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PhkbQ7TSH2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PhkbQ7TSH2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PhkbQ7TSH2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PhkbQ7TSH2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PhkbQ7TSH2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PhkbQ7TSH2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PhkbQ7TSH2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PhkbQ7TSH2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PhkbQ7TSH2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PhkbQ7TSH2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PhkbQ7TSH2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PhkbQ7TSH2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PhkbQ7TSH2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PhkbQ7TSH2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PhkbQ7TSH2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PhkbQ7TSH2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PhkbQ7TSH2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PhkbQ7TSH2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PhkbQ7TSH2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PhkbQ7TSH2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PhkbQ7TSH2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PhkbQ7TSH2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PhkbQ7TSH2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PhkbQ7TSH2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PhkbQ7TSH2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PhkbQ7TSH2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PhkbQ7TSH2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PhkbQ7TSH2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PhkbQ7TSH2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PhkbQ7TSH2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PhkbQ7TSH2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PhkbQ7TSH2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PhkbQ7TSH2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PhkbQ7TSH2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PhkbQ7TSH2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PhkbQ7TSH2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PhkbQ7TSH2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PhkbQ7TSH2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PhkbQ7TSH2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PhkbQ7TSH2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PhkbQ7TSH2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PhkbQ7TSH2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PhkbQ7TSH2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PhkbQ7TSH2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PhkbQ7TSH2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PhkbQ7TSH2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PhkbQ7TSH2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PhkbQ7TSH2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PhkbQ7TSH2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PhkbQ7TSH2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PhkbQ7TSH2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PhkbQ7TSH2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PhkbQ7TSH2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PhkbQ7TSH2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PhkbQ7TSH2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PhkbQ7TSH2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PhkbQ7TSH2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PhkbQ7TSH2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PhkbQ7TSH2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PhkbQ7TSH2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PhkbQ7TSH2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PhkbQ7TSH2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
PhkbQ7TSH2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PhkbQ7TSH2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PhkbQ7TSH2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PhkbQ7TSH2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PhkbQ7TSH2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PhkbQ7TSH2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PhkbQ7TSH2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PhkbQ7TSH2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PhkbQ7TSH2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PhkbQ7TSH2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PhkbQ7TSH2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PhkbQ7TSH2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PhkbQ7TSH2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms