Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN37

Trpm4, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm4Q7TN37 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm4Q7TN37 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm4Q7TN37 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm4Q7TN37 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm4Q7TN37 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm4Q7TN37 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm4Q7TN37 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm4Q7TN37 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm4Q7TN37 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm4Q7TN37 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm4Q7TN37 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm4Q7TN37 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpm4Q7TN37 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpm4Q7TN37 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm4Q7TN37 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm4Q7TN37 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm4Q7TN37 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm4Q7TN37 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm4Q7TN37 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm4Q7TN37 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm4Q7TN37 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm4Q7TN37 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm4Q7TN37 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm4Q7TN37 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm4Q7TN37 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm4Q7TN37 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm4Q7TN37 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm4Q7TN37 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm4Q7TN37 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm4Q7TN37 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm4Q7TN37 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm4Q7TN37 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trpm4Q7TN37 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm4Q7TN37 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm4Q7TN37 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm4Q7TN37 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm4Q7TN37 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm4Q7TN37 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm4Q7TN37 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm4Q7TN37 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm4Q7TN37 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm4Q7TN37 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpm4Q7TN37 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpm4Q7TN37 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm4Q7TN37 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpm4Q7TN37 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms