Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AY358078Q6UY53 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AY358078Q6UY53 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AY358078Q6UY53 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AY358078Q6UY53 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AY358078Q6UY53 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AY358078Q6UY53 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AY358078Q6UY53 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AY358078Q6UY53 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AY358078Q6UY53 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AY358078Q6UY53 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AY358078Q6UY53 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AY358078Q6UY53 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AY358078Q6UY53 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms