Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Soga3Q6NZL0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Soga3Q6NZL0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Soga3Q6NZL0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Soga3Q6NZL0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Soga3Q6NZL0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Soga3Q6NZL0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Soga3Q6NZL0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Soga3Q6NZL0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Soga3Q6NZL0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Soga3Q6NZL0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Soga3Q6NZL0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Soga3Q6NZL0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Soga3Q6NZL0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Soga3Q6NZL0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Soga3Q6NZL0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Soga3Q6NZL0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Soga3Q6NZL0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Soga3Q6NZL0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Soga3Q6NZL0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Soga3Q6NZL0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Soga3Q6NZL0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Soga3Q6NZL0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Soga3Q6NZL0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Soga3Q6NZL0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Soga3Q6NZL0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Soga3Q6NZL0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Soga3Q6NZL0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Soga3Q6NZL0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Soga3Q6NZL0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Soga3Q6NZL0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Soga3Q6NZL0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Soga3Q6NZL0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Soga3Q6NZL0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Soga3Q6NZL0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Soga3Q6NZL0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Soga3Q6NZL0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Soga3Q6NZL0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Soga3Q6NZL0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Soga3Q6NZL0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Soga3Q6NZL0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Soga3Q6NZL0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Soga3Q6NZL0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Soga3Q6NZL0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Soga3Q6NZL0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Soga3Q6NZL0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Soga3Q6NZL0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Soga3Q6NZL0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Soga3Q6NZL0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Soga3Q6NZL0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Soga3Q6NZL0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Soga3Q6NZL0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Soga3Q6NZL0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Soga3Q6NZL0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Soga3Q6NZL0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Soga3Q6NZL0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Soga3Q6NZL0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Soga3Q6NZL0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Soga3Q6NZL0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Soga3Q6NZL0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Soga3Q6NZL0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Soga3Q6NZL0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Soga3Q6NZL0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Soga3Q6NZL0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Soga3Q6NZL0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Soga3Q6NZL0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Soga3Q6NZL0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms