Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NipblQ6KCD5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
NipblQ6KCD5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NipblQ6KCD5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NipblQ6KCD5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NipblQ6KCD5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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