Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pdzrn3Q69ZS0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pdzrn3Q69ZS0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pdzrn3Q69ZS0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pdzrn3Q69ZS0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pdzrn3Q69ZS0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pdzrn3Q69ZS0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pdzrn3Q69ZS0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pdzrn3Q69ZS0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pdzrn3Q69ZS0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pdzrn3Q69ZS0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Pdzrn3Q69ZS0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pdzrn3Q69ZS0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdzrn3Q69ZS0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdzrn3Q69ZS0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdzrn3Q69ZS0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pdzrn3Q69ZS0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pdzrn3Q69ZS0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pdzrn3Q69ZS0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pdzrn3Q69ZS0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pdzrn3Q69ZS0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pdzrn3Q69ZS0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pdzrn3Q69ZS0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pdzrn3Q69ZS0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pdzrn3Q69ZS0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pdzrn3Q69ZS0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pdzrn3Q69ZS0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pdzrn3Q69ZS0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Pdzrn3Q69ZS0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pdzrn3Q69ZS0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pdzrn3Q69ZS0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pdzrn3Q69ZS0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pdzrn3Q69ZS0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pdzrn3Q69ZS0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Pdzrn3Q69ZS0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pdzrn3Q69ZS0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pdzrn3Q69ZS0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pdzrn3Q69ZS0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pdzrn3Q69ZS0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pdzrn3Q69ZS0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pdzrn3Q69ZS0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pdzrn3Q69ZS0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pdzrn3Q69ZS0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pdzrn3Q69ZS0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pdzrn3Q69ZS0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pdzrn3Q69ZS0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pdzrn3Q69ZS0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Pdzrn3Q69ZS0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pdzrn3Q69ZS0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pdzrn3Q69ZS0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pdzrn3Q69ZS0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pdzrn3Q69ZS0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdzrn3Q69ZS0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdzrn3Q69ZS0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pdzrn3Q69ZS0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pdzrn3Q69ZS0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pdzrn3Q69ZS0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pdzrn3Q69ZS0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pdzrn3Q69ZS0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pdzrn3Q69ZS0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdzrn3Q69ZS0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Pdzrn3Q69ZS0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pdzrn3Q69ZS0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pdzrn3Q69ZS0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pdzrn3Q69ZS0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdzrn3Q69ZS0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pdzrn3Q69ZS0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdzrn3Q69ZS0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 781.7 ms