Protein–RNA interactions for Protein: Q67DU8

Clec4b2, Antigen presenting cell lectin-like receptor A1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b2Q67DU8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec4b2Q67DU8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec4b2Q67DU8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec4b2Q67DU8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec4b2Q67DU8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec4b2Q67DU8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec4b2Q67DU8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec4b2Q67DU8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec4b2Q67DU8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec4b2Q67DU8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec4b2Q67DU8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec4b2Q67DU8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec4b2Q67DU8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec4b2Q67DU8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec4b2Q67DU8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clec4b2Q67DU8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Clec4b2Q67DU8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Clec4b2Q67DU8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clec4b2Q67DU8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clec4b2Q67DU8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms