Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
NinQ61043 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28,98■■■□□ 2,23
NinQ61043 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
NinQ61043 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
NinQ61043 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
NinQ61043 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
NinQ61043 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
NinQ61043 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,23
NinQ61043 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
NinQ61043 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
NinQ61043 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
NinQ61043 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
NinQ61043 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
NinQ61043 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
NinQ61043 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
NinQ61043 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
NinQ61043 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
NinQ61043 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
NinQ61043 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
NinQ61043 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
NinQ61043 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
NinQ61043 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
NinQ61043 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
NinQ61043 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
NinQ61043 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
NinQ61043 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
NinQ61043 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
NinQ61043 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
NinQ61043 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
NinQ61043 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
NinQ61043 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
NinQ61043 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
NinQ61043 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
NinQ61043 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
NinQ61043 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28,79■■■□□ 2,2
NinQ61043 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28,79■■■□□ 2,2
NinQ61043 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
NinQ61043 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
NinQ61043 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
NinQ61043 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
NinQ61043 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
NinQ61043 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
NinQ61043 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28,76■■■□□ 2,19
NinQ61043 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
NinQ61043 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
NinQ61043 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
NinQ61043 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
NinQ61043 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
NinQ61043 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
NinQ61043 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
NinQ61043 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28,72■■■□□ 2,19
NinQ61043 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28,72■■■□□ 2,19
NinQ61043 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28,7■■■□□ 2,19
NinQ61043 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
NinQ61043 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28,7■■■□□ 2,18
NinQ61043 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28,7■■■□□ 2,18
NinQ61043 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
NinQ61043 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
NinQ61043 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28,67■■■□□ 2,18
NinQ61043 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
NinQ61043 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,66■■■□□ 2,18
NinQ61043 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
NinQ61043 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
NinQ61043 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
NinQ61043 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
NinQ61043 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
NinQ61043 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
NinQ61043 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
NinQ61043 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
NinQ61043 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
NinQ61043 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
NinQ61043 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
NinQ61043 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28,62■■■□□ 2,17
NinQ61043 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
NinQ61043 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
NinQ61043 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
NinQ61043 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
NinQ61043 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
NinQ61043 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28,6■■■□□ 2,17
NinQ61043 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
NinQ61043 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
NinQ61043 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
NinQ61043 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
NinQ61043 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
NinQ61043 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
NinQ61043 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
NinQ61043 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
NinQ61043 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
NinQ61043 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
NinQ61043 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
NinQ61043 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
NinQ61043 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
NinQ61043 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,53■■■□□ 2,16
NinQ61043 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
NinQ61043 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
NinQ61043 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
NinQ61043 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
NinQ61043 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
NinQ61043 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
NinQ61043 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,8 ms