Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Atf3Q60765 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Atf3Q60765 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Atf3Q60765 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Atf3Q60765 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Atf3Q60765 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Atf3Q60765 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Atf3Q60765 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Atf3Q60765 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atf3Q60765 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atf3Q60765 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atf3Q60765 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Atf3Q60765 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Atf3Q60765 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Atf3Q60765 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Atf3Q60765 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Atf3Q60765 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Atf3Q60765 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atf3Q60765 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atf3Q60765 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Atf3Q60765 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Atf3Q60765 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Atf3Q60765 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Atf3Q60765 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Atf3Q60765 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Atf3Q60765 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Atf3Q60765 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Atf3Q60765 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Atf3Q60765 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Atf3Q60765 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Atf3Q60765 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Atf3Q60765 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Atf3Q60765 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Atf3Q60765 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Atf3Q60765 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Atf3Q60765 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Atf3Q60765 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Atf3Q60765 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Atf3Q60765 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Atf3Q60765 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Atf3Q60765 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Atf3Q60765 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Atf3Q60765 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Atf3Q60765 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Atf3Q60765 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Atf3Q60765 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Atf3Q60765 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Atf3Q60765 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Atf3Q60765 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Atf3Q60765 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Atf3Q60765 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Atf3Q60765 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Atf3Q60765 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Atf3Q60765 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Atf3Q60765 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Atf3Q60765 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Atf3Q60765 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Atf3Q60765 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atf3Q60765 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atf3Q60765 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Atf3Q60765 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Atf3Q60765 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Atf3Q60765 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Atf3Q60765 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Atf3Q60765 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Atf3Q60765 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Atf3Q60765 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Atf3Q60765 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Atf3Q60765 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Atf3Q60765 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Atf3Q60765 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Atf3Q60765 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Atf3Q60765 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Atf3Q60765 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Atf3Q60765 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Atf3Q60765 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Atf3Q60765 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Atf3Q60765 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Atf3Q60765 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Atf3Q60765 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Atf3Q60765 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Atf3Q60765 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Atf3Q60765 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Atf3Q60765 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Atf3Q60765 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Atf3Q60765 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Atf3Q60765 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Atf3Q60765 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Atf3Q60765 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Atf3Q60765 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Atf3Q60765 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Atf3Q60765 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Atf3Q60765 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Atf3Q60765 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Atf3Q60765 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Atf3Q60765 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Atf3Q60765 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Atf3Q60765 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Atf3Q60765 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Atf3Q60765 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms