Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PmelQ60696 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PmelQ60696 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PmelQ60696 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PmelQ60696 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PmelQ60696 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PmelQ60696 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PmelQ60696 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PmelQ60696 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PmelQ60696 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PmelQ60696 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PmelQ60696 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PmelQ60696 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PmelQ60696 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PmelQ60696 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PmelQ60696 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PmelQ60696 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PmelQ60696 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PmelQ60696 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PmelQ60696 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PmelQ60696 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PmelQ60696 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PmelQ60696 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PmelQ60696 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PmelQ60696 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PmelQ60696 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PmelQ60696 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms