Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec4a4Q5YIR8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clec4a4Q5YIR8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clec4a4Q5YIR8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec4a4Q5YIR8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec4a4Q5YIR8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec4a4Q5YIR8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec4a4Q5YIR8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec4a4Q5YIR8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec4a4Q5YIR8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec4a4Q5YIR8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec4a4Q5YIR8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec4a4Q5YIR8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec4a4Q5YIR8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec4a4Q5YIR8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec4a4Q5YIR8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec4a4Q5YIR8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec4a4Q5YIR8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec4a4Q5YIR8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec4a4Q5YIR8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec4a4Q5YIR8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec4a4Q5YIR8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec4a4Q5YIR8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec4a4Q5YIR8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec4a4Q5YIR8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec4a4Q5YIR8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec4a4Q5YIR8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec4a4Q5YIR8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec4a4Q5YIR8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec4a4Q5YIR8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec4a4Q5YIR8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec4a4Q5YIR8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clec4a4Q5YIR8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec4a4Q5YIR8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clec4a4Q5YIR8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec4a4Q5YIR8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec4a4Q5YIR8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms