Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E2

Repin1, Replication initiator 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Repin1Q5U4E2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Repin1Q5U4E2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Repin1Q5U4E2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Repin1Q5U4E2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Repin1Q5U4E2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Repin1Q5U4E2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Repin1Q5U4E2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Repin1Q5U4E2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Repin1Q5U4E2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Repin1Q5U4E2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Repin1Q5U4E2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Repin1Q5U4E2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Repin1Q5U4E2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Repin1Q5U4E2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Repin1Q5U4E2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Repin1Q5U4E2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Repin1Q5U4E2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Repin1Q5U4E2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Repin1Q5U4E2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Repin1Q5U4E2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Repin1Q5U4E2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Repin1Q5U4E2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Repin1Q5U4E2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Repin1Q5U4E2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Repin1Q5U4E2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Repin1Q5U4E2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Repin1Q5U4E2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Repin1Q5U4E2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Repin1Q5U4E2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Repin1Q5U4E2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Repin1Q5U4E2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Repin1Q5U4E2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Repin1Q5U4E2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Repin1Q5U4E2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Repin1Q5U4E2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Repin1Q5U4E2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Repin1Q5U4E2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Repin1Q5U4E2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Repin1Q5U4E2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Repin1Q5U4E2 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Repin1Q5U4E2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Repin1Q5U4E2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Repin1Q5U4E2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Repin1Q5U4E2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms