Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam71bQ5STT6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam71bQ5STT6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam71bQ5STT6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam71bQ5STT6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam71bQ5STT6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam71bQ5STT6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam71bQ5STT6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms