Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sft2d1Q5SSN7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sft2d1Q5SSN7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms