Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Taf3Q5HZG4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Taf3Q5HZG4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Taf3Q5HZG4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Taf3Q5HZG4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Taf3Q5HZG4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Taf3Q5HZG4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Taf3Q5HZG4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Taf3Q5HZG4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Taf3Q5HZG4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Taf3Q5HZG4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Taf3Q5HZG4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Taf3Q5HZG4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Taf3Q5HZG4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Taf3Q5HZG4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf3Q5HZG4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf3Q5HZG4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf3Q5HZG4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf3Q5HZG4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf3Q5HZG4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf3Q5HZG4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf3Q5HZG4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf3Q5HZG4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf3Q5HZG4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf3Q5HZG4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Taf3Q5HZG4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Taf3Q5HZG4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Taf3Q5HZG4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Taf3Q5HZG4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Taf3Q5HZG4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Taf3Q5HZG4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Taf3Q5HZG4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Taf3Q5HZG4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Taf3Q5HZG4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf3Q5HZG4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf3Q5HZG4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf3Q5HZG4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf3Q5HZG4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms