Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp13Q5BKP2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp13Q5BKP2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp13Q5BKP2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp13Q5BKP2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp13Q5BKP2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp13Q5BKP2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp13Q5BKP2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp13Q5BKP2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp13Q5BKP2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp13Q5BKP2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp13Q5BKP2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp13Q5BKP2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp13Q5BKP2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp13Q5BKP2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp13Q5BKP2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp13Q5BKP2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp13Q5BKP2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp13Q5BKP2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp13Q5BKP2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp13Q5BKP2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp13Q5BKP2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp13Q5BKP2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp13Q5BKP2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp13Q5BKP2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp13Q5BKP2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp13Q5BKP2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp13Q5BKP2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp13Q5BKP2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp13Q5BKP2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp13Q5BKP2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp13Q5BKP2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp13Q5BKP2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp13Q5BKP2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp13Q5BKP2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp13Q5BKP2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp13Q5BKP2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp13Q5BKP2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp13Q5BKP2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp13Q5BKP2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp13Q5BKP2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp13Q5BKP2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp13Q5BKP2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp13Q5BKP2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp13Q5BKP2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp13Q5BKP2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp13Q5BKP2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp13Q5BKP2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp13Q5BKP2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp13Q5BKP2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp13Q5BKP2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp13Q5BKP2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp13Q5BKP2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp13Q5BKP2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp13Q5BKP2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp13Q5BKP2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp13Q5BKP2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp13Q5BKP2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp13Q5BKP2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Usp13Q5BKP2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp13Q5BKP2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp13Q5BKP2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp13Q5BKP2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp13Q5BKP2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp13Q5BKP2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp13Q5BKP2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp13Q5BKP2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp13Q5BKP2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp13Q5BKP2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp13Q5BKP2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp13Q5BKP2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp13Q5BKP2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp13Q5BKP2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Usp13Q5BKP2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp13Q5BKP2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp13Q5BKP2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp13Q5BKP2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp13Q5BKP2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp13Q5BKP2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp13Q5BKP2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp13Q5BKP2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp13Q5BKP2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp13Q5BKP2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp13Q5BKP2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp13Q5BKP2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp13Q5BKP2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp13Q5BKP2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp13Q5BKP2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp13Q5BKP2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp13Q5BKP2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp13Q5BKP2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp13Q5BKP2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp13Q5BKP2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp13Q5BKP2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp13Q5BKP2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp13Q5BKP2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp13Q5BKP2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp13Q5BKP2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp13Q5BKP2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp13Q5BKP2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms