Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Znf608Q56A10 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Znf608Q56A10 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Znf608Q56A10 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Znf608Q56A10 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Znf608Q56A10 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Znf608Q56A10 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Znf608Q56A10 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Znf608Q56A10 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Znf608Q56A10 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Znf608Q56A10 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Znf608Q56A10 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Znf608Q56A10 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Znf608Q56A10 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Znf608Q56A10 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Znf608Q56A10 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Znf608Q56A10 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Znf608Q56A10 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Znf608Q56A10 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Znf608Q56A10 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Znf608Q56A10 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Znf608Q56A10 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Znf608Q56A10 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Znf608Q56A10 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Znf608Q56A10 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Znf608Q56A10 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Znf608Q56A10 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Znf608Q56A10 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Znf608Q56A10 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Znf608Q56A10 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Znf608Q56A10 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Znf608Q56A10 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Znf608Q56A10 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Znf608Q56A10 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Znf608Q56A10 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Znf608Q56A10 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Znf608Q56A10 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Znf608Q56A10 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Znf608Q56A10 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Znf608Q56A10 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Znf608Q56A10 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Znf608Q56A10 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Znf608Q56A10 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Znf608Q56A10 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Znf608Q56A10 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Znf608Q56A10 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Znf608Q56A10 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Znf608Q56A10 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
Znf608Q56A10 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Znf608Q56A10 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Znf608Q56A10 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Znf608Q56A10 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Znf608Q56A10 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Znf608Q56A10 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Znf608Q56A10 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Znf608Q56A10 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Znf608Q56A10 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Znf608Q56A10 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Znf608Q56A10 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Znf608Q56A10 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Znf608Q56A10 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Znf608Q56A10 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Znf608Q56A10 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Znf608Q56A10 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Znf608Q56A10 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Znf608Q56A10 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Znf608Q56A10 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Znf608Q56A10 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Znf608Q56A10 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Znf608Q56A10 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Znf608Q56A10 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Znf608Q56A10 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Znf608Q56A10 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Znf608Q56A10 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Znf608Q56A10 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Znf608Q56A10 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Znf608Q56A10 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
Znf608Q56A10 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Znf608Q56A10 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Znf608Q56A10 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Znf608Q56A10 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Znf608Q56A10 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Znf608Q56A10 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Znf608Q56A10 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Znf608Q56A10 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Znf608Q56A10 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Znf608Q56A10 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Znf608Q56A10 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Znf608Q56A10 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Znf608Q56A10 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Znf608Q56A10 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Znf608Q56A10 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Znf608Q56A10 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Znf608Q56A10 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Znf608Q56A10 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Znf608Q56A10 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Znf608Q56A10 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Znf608Q56A10 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Znf608Q56A10 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Znf608Q56A10 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms