Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
4933416C03RikQ3V063 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
4933416C03RikQ3V063 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
4933416C03RikQ3V063 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
4933416C03RikQ3V063 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
4933416C03RikQ3V063 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
4933416C03RikQ3V063 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
4933416C03RikQ3V063 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29■■■□□ 2.23
4933416C03RikQ3V063 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
4933416C03RikQ3V063 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
4933416C03RikQ3V063 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
4933416C03RikQ3V063 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
4933416C03RikQ3V063 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
4933416C03RikQ3V063 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
4933416C03RikQ3V063 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
4933416C03RikQ3V063 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
4933416C03RikQ3V063 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
4933416C03RikQ3V063 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
4933416C03RikQ3V063 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
4933416C03RikQ3V063 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
4933416C03RikQ3V063 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
4933416C03RikQ3V063 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
4933416C03RikQ3V063 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
4933416C03RikQ3V063 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
4933416C03RikQ3V063 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
4933416C03RikQ3V063 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
4933416C03RikQ3V063 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
4933416C03RikQ3V063 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
4933416C03RikQ3V063 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
4933416C03RikQ3V063 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
4933416C03RikQ3V063 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
4933416C03RikQ3V063 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
4933416C03RikQ3V063 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
4933416C03RikQ3V063 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
4933416C03RikQ3V063 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
4933416C03RikQ3V063 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
4933416C03RikQ3V063 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
4933416C03RikQ3V063 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
4933416C03RikQ3V063 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
4933416C03RikQ3V063 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
4933416C03RikQ3V063 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
4933416C03RikQ3V063 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
4933416C03RikQ3V063 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
4933416C03RikQ3V063 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
4933416C03RikQ3V063 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
4933416C03RikQ3V063 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
4933416C03RikQ3V063 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
4933416C03RikQ3V063 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
4933416C03RikQ3V063 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
4933416C03RikQ3V063 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
4933416C03RikQ3V063 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
4933416C03RikQ3V063 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
4933416C03RikQ3V063 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
4933416C03RikQ3V063 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
4933416C03RikQ3V063 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
4933416C03RikQ3V063 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4933416C03RikQ3V063 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4933416C03RikQ3V063 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4933416C03RikQ3V063 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4933416C03RikQ3V063 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
4933416C03RikQ3V063 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4933416C03RikQ3V063 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4933416C03RikQ3V063 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
4933416C03RikQ3V063 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
4933416C03RikQ3V063 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
4933416C03RikQ3V063 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
4933416C03RikQ3V063 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
4933416C03RikQ3V063 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4933416C03RikQ3V063 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
4933416C03RikQ3V063 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4933416C03RikQ3V063 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
4933416C03RikQ3V063 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
4933416C03RikQ3V063 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
4933416C03RikQ3V063 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
4933416C03RikQ3V063 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4933416C03RikQ3V063 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4933416C03RikQ3V063 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4933416C03RikQ3V063 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4933416C03RikQ3V063 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4933416C03RikQ3V063 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
4933416C03RikQ3V063 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
4933416C03RikQ3V063 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms