Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX43

Ankrd13c, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd13cQ3UX43 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ankrd13cQ3UX43 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ankrd13cQ3UX43 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ankrd13cQ3UX43 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ankrd13cQ3UX43 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ankrd13cQ3UX43 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ankrd13cQ3UX43 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ankrd13cQ3UX43 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ankrd13cQ3UX43 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ankrd13cQ3UX43 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ankrd13cQ3UX43 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ankrd13cQ3UX43 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ankrd13cQ3UX43 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ankrd13cQ3UX43 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ankrd13cQ3UX43 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ankrd13cQ3UX43 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ankrd13cQ3UX43 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ankrd13cQ3UX43 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ankrd13cQ3UX43 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ankrd13cQ3UX43 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ankrd13cQ3UX43 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ankrd13cQ3UX43 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ankrd13cQ3UX43 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ankrd13cQ3UX43 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ankrd13cQ3UX43 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ankrd13cQ3UX43 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ankrd13cQ3UX43 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ankrd13cQ3UX43 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ankrd13cQ3UX43 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ankrd13cQ3UX43 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ankrd13cQ3UX43 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ankrd13cQ3UX43 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ankrd13cQ3UX43 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ankrd13cQ3UX43 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ankrd13cQ3UX43 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ankrd13cQ3UX43 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ankrd13cQ3UX43 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ankrd13cQ3UX43 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ankrd13cQ3UX43 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ankrd13cQ3UX43 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ankrd13cQ3UX43 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ankrd13cQ3UX43 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ankrd13cQ3UX43 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ankrd13cQ3UX43 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ankrd13cQ3UX43 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ankrd13cQ3UX43 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ankrd13cQ3UX43 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ankrd13cQ3UX43 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ankrd13cQ3UX43 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ankrd13cQ3UX43 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ankrd13cQ3UX43 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ankrd13cQ3UX43 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ankrd13cQ3UX43 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ankrd13cQ3UX43 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ankrd13cQ3UX43 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ankrd13cQ3UX43 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ankrd13cQ3UX43 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ankrd13cQ3UX43 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ankrd13cQ3UX43 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ankrd13cQ3UX43 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ankrd13cQ3UX43 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ankrd13cQ3UX43 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ankrd13cQ3UX43 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ankrd13cQ3UX43 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ankrd13cQ3UX43 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ankrd13cQ3UX43 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ankrd13cQ3UX43 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ankrd13cQ3UX43 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ankrd13cQ3UX43 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ankrd13cQ3UX43 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ankrd13cQ3UX43 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ankrd13cQ3UX43 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ankrd13cQ3UX43 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ankrd13cQ3UX43 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ankrd13cQ3UX43 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ankrd13cQ3UX43 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ankrd13cQ3UX43 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ankrd13cQ3UX43 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ankrd13cQ3UX43 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ankrd13cQ3UX43 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ankrd13cQ3UX43 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ankrd13cQ3UX43 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms