Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX43

Ankrd13c, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd13cQ3UX43 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Ankrd13cQ3UX43 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Ankrd13cQ3UX43 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Ankrd13cQ3UX43 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Ankrd13cQ3UX43 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Ankrd13cQ3UX43 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ankrd13cQ3UX43 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ankrd13cQ3UX43 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ankrd13cQ3UX43 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ankrd13cQ3UX43 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ankrd13cQ3UX43 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Ankrd13cQ3UX43 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28,48■■■□□ 2,15
Ankrd13cQ3UX43 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ankrd13cQ3UX43 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ankrd13cQ3UX43 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Ankrd13cQ3UX43 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Ankrd13cQ3UX43 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Ankrd13cQ3UX43 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Ankrd13cQ3UX43 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Ankrd13cQ3UX43 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Ankrd13cQ3UX43 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ankrd13cQ3UX43 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Ankrd13cQ3UX43 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ankrd13cQ3UX43 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ankrd13cQ3UX43 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Ankrd13cQ3UX43 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Ankrd13cQ3UX43 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Ankrd13cQ3UX43 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Ankrd13cQ3UX43 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ankrd13cQ3UX43 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ankrd13cQ3UX43 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ankrd13cQ3UX43 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Ankrd13cQ3UX43 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Ankrd13cQ3UX43 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Ankrd13cQ3UX43 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Ankrd13cQ3UX43 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Ankrd13cQ3UX43 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Ankrd13cQ3UX43 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Ankrd13cQ3UX43 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Ankrd13cQ3UX43 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
Ankrd13cQ3UX43 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Ankrd13cQ3UX43 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ankrd13cQ3UX43 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Ankrd13cQ3UX43 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Ankrd13cQ3UX43 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Ankrd13cQ3UX43 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ankrd13cQ3UX43 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ankrd13cQ3UX43 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ankrd13cQ3UX43 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Ankrd13cQ3UX43 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Ankrd13cQ3UX43 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Ankrd13cQ3UX43 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Ankrd13cQ3UX43 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Ankrd13cQ3UX43 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ankrd13cQ3UX43 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ankrd13cQ3UX43 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28,2■■■□□ 2,1
Ankrd13cQ3UX43 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Ankrd13cQ3UX43 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Ankrd13cQ3UX43 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ankrd13cQ3UX43 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Ankrd13cQ3UX43 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Ankrd13cQ3UX43 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ankrd13cQ3UX43 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ankrd13cQ3UX43 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Ankrd13cQ3UX43 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Ankrd13cQ3UX43 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Ankrd13cQ3UX43 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Ankrd13cQ3UX43 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Ankrd13cQ3UX43 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Ankrd13cQ3UX43 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Ankrd13cQ3UX43 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Ankrd13cQ3UX43 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Ankrd13cQ3UX43 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ankrd13cQ3UX43 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ankrd13cQ3UX43 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ankrd13cQ3UX43 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ankrd13cQ3UX43 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Ankrd13cQ3UX43 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Ankrd13cQ3UX43 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Ankrd13cQ3UX43 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Ankrd13cQ3UX43 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Ankrd13cQ3UX43 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms