Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Skap1Q3UUV5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Skap1Q3UUV5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Skap1Q3UUV5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Skap1Q3UUV5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Skap1Q3UUV5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Skap1Q3UUV5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms