Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smim15Q3UTD9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim15Q3UTD9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim15Q3UTD9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim15Q3UTD9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms