Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Arfgef3Q3UGY8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Arfgef3Q3UGY8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Arfgef3Q3UGY8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Arfgef3Q3UGY8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Arfgef3Q3UGY8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Arfgef3Q3UGY8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Arfgef3Q3UGY8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Arfgef3Q3UGY8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Arfgef3Q3UGY8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Arfgef3Q3UGY8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Arfgef3Q3UGY8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Arfgef3Q3UGY8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22,01■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Arfgef3Q3UGY8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21,93■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21,89■■□□□ 1,1
Arfgef3Q3UGY8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21,88■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21,87■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21,84■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21,83■■□□□ 1,09
Arfgef3Q3UGY8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21,82■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,81■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21,81■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21,79■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21,79■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21,77■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Arfgef3Q3UGY8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21,74■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21,72■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Arfgef3Q3UGY8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44,2 ms