Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Garem1Q3UFT3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Garem1Q3UFT3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Garem1Q3UFT3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Garem1Q3UFT3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Garem1Q3UFT3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Garem1Q3UFT3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Garem1Q3UFT3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Garem1Q3UFT3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Garem1Q3UFT3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Garem1Q3UFT3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Garem1Q3UFT3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Garem1Q3UFT3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Garem1Q3UFT3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Garem1Q3UFT3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Garem1Q3UFT3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Garem1Q3UFT3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Garem1Q3UFT3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Garem1Q3UFT3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Garem1Q3UFT3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Garem1Q3UFT3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Garem1Q3UFT3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Garem1Q3UFT3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Garem1Q3UFT3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Garem1Q3UFT3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Garem1Q3UFT3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Garem1Q3UFT3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Garem1Q3UFT3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Garem1Q3UFT3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Garem1Q3UFT3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Garem1Q3UFT3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Garem1Q3UFT3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Garem1Q3UFT3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Garem1Q3UFT3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Garem1Q3UFT3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Garem1Q3UFT3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Garem1Q3UFT3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Garem1Q3UFT3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Garem1Q3UFT3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Garem1Q3UFT3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Garem1Q3UFT3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Garem1Q3UFT3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Garem1Q3UFT3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Garem1Q3UFT3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms