Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnft2Q3UF64 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnft2Q3UF64 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnft2Q3UF64 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnft2Q3UF64 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnft2Q3UF64 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnft2Q3UF64 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms