Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX3

Zfyve27, Protrudin, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfyve27Q3TXX3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfyve27Q3TXX3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfyve27Q3TXX3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfyve27Q3TXX3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfyve27Q3TXX3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfyve27Q3TXX3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfyve27Q3TXX3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfyve27Q3TXX3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfyve27Q3TXX3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfyve27Q3TXX3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfyve27Q3TXX3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfyve27Q3TXX3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfyve27Q3TXX3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfyve27Q3TXX3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfyve27Q3TXX3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfyve27Q3TXX3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfyve27Q3TXX3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfyve27Q3TXX3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfyve27Q3TXX3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfyve27Q3TXX3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfyve27Q3TXX3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfyve27Q3TXX3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfyve27Q3TXX3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfyve27Q3TXX3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfyve27Q3TXX3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfyve27Q3TXX3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfyve27Q3TXX3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfyve27Q3TXX3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfyve27Q3TXX3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfyve27Q3TXX3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfyve27Q3TXX3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfyve27Q3TXX3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfyve27Q3TXX3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfyve27Q3TXX3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfyve27Q3TXX3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfyve27Q3TXX3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfyve27Q3TXX3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfyve27Q3TXX3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfyve27Q3TXX3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms