Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdlim7Q3TJD7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pdlim7Q3TJD7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pdlim7Q3TJD7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pdlim7Q3TJD7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdlim7Q3TJD7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdlim7Q3TJD7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdlim7Q3TJD7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdlim7Q3TJD7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdlim7Q3TJD7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdlim7Q3TJD7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdlim7Q3TJD7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdlim7Q3TJD7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pdlim7Q3TJD7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pdlim7Q3TJD7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Pdlim7Q3TJD7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdlim7Q3TJD7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdlim7Q3TJD7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdlim7Q3TJD7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdlim7Q3TJD7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdlim7Q3TJD7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdlim7Q3TJD7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdlim7Q3TJD7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pdlim7Q3TJD7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pdlim7Q3TJD7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pdlim7Q3TJD7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdlim7Q3TJD7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdlim7Q3TJD7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdlim7Q3TJD7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdlim7Q3TJD7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pdlim7Q3TJD7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdlim7Q3TJD7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdlim7Q3TJD7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdlim7Q3TJD7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Pdlim7Q3TJD7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdlim7Q3TJD7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdlim7Q3TJD7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pdlim7Q3TJD7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdlim7Q3TJD7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Pdlim7Q3TJD7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pdlim7Q3TJD7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdlim7Q3TJD7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdlim7Q3TJD7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pdlim7Q3TJD7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdlim7Q3TJD7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdlim7Q3TJD7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pdlim7Q3TJD7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdlim7Q3TJD7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pdlim7Q3TJD7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdlim7Q3TJD7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdlim7Q3TJD7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms