Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdgfl1Q2VPR5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdgfl1Q2VPR5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdgfl1Q2VPR5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdgfl1Q2VPR5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdgfl1Q2VPR5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdgfl1Q2VPR5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdgfl1Q2VPR5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdgfl1Q2VPR5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdgfl1Q2VPR5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdgfl1Q2VPR5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdgfl1Q2VPR5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdgfl1Q2VPR5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdgfl1Q2VPR5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdgfl1Q2VPR5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdgfl1Q2VPR5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdgfl1Q2VPR5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdgfl1Q2VPR5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdgfl1Q2VPR5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdgfl1Q2VPR5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdgfl1Q2VPR5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdgfl1Q2VPR5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdgfl1Q2VPR5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdgfl1Q2VPR5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdgfl1Q2VPR5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdgfl1Q2VPR5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hdgfl1Q2VPR5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdgfl1Q2VPR5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdgfl1Q2VPR5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdgfl1Q2VPR5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdgfl1Q2VPR5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdgfl1Q2VPR5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdgfl1Q2VPR5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdgfl1Q2VPR5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdgfl1Q2VPR5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdgfl1Q2VPR5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdgfl1Q2VPR5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdgfl1Q2VPR5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdgfl1Q2VPR5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms