Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpusd3Q14AI6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpusd3Q14AI6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpusd3Q14AI6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpusd3Q14AI6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd3Q14AI6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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