Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Perm1Q149B8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Perm1Q149B8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Perm1Q149B8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Perm1Q149B8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Perm1Q149B8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Perm1Q149B8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Perm1Q149B8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Perm1Q149B8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Perm1Q149B8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Perm1Q149B8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Perm1Q149B8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Perm1Q149B8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Perm1Q149B8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Perm1Q149B8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Perm1Q149B8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Perm1Q149B8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Perm1Q149B8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Perm1Q149B8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Perm1Q149B8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Perm1Q149B8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Perm1Q149B8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Perm1Q149B8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Perm1Q149B8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Perm1Q149B8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Perm1Q149B8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Perm1Q149B8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Perm1Q149B8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Perm1Q149B8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Perm1Q149B8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Perm1Q149B8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Perm1Q149B8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Perm1Q149B8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Perm1Q149B8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Perm1Q149B8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Perm1Q149B8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Perm1Q149B8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Perm1Q149B8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Perm1Q149B8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Perm1Q149B8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Perm1Q149B8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Perm1Q149B8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Perm1Q149B8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Perm1Q149B8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Perm1Q149B8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Perm1Q149B8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Perm1Q149B8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Perm1Q149B8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Perm1Q149B8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Perm1Q149B8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Perm1Q149B8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Perm1Q149B8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Perm1Q149B8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Perm1Q149B8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Perm1Q149B8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Perm1Q149B8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Perm1Q149B8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Perm1Q149B8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Perm1Q149B8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Perm1Q149B8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Perm1Q149B8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Perm1Q149B8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
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