Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG34

4930480E11Rik, MCG52719, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930480E11RikQ0VG34 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930480E11RikQ0VG34 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930480E11RikQ0VG34 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930480E11RikQ0VG34 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4930480E11RikQ0VG34 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930480E11RikQ0VG34 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930480E11RikQ0VG34 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930480E11RikQ0VG34 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930480E11RikQ0VG34 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930480E11RikQ0VG34 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4930480E11RikQ0VG34 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930480E11RikQ0VG34 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930480E11RikQ0VG34 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930480E11RikQ0VG34 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930480E11RikQ0VG34 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930480E11RikQ0VG34 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930480E11RikQ0VG34 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930480E11RikQ0VG34 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930480E11RikQ0VG34 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930480E11RikQ0VG34 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930480E11RikQ0VG34 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms