Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc45a4Q0P5V9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc45a4Q0P5V9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc45a4Q0P5V9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc45a4Q0P5V9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc45a4Q0P5V9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc45a4Q0P5V9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc45a4Q0P5V9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc45a4Q0P5V9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc45a4Q0P5V9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc45a4Q0P5V9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc45a4Q0P5V9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc45a4Q0P5V9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc45a4Q0P5V9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc45a4Q0P5V9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc45a4Q0P5V9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc45a4Q0P5V9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc45a4Q0P5V9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc45a4Q0P5V9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc45a4Q0P5V9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc45a4Q0P5V9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc45a4Q0P5V9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms